Kirkkoneuvosto
Kirkkoneuvosto johtaa seurakunnan käytännön toimintaa ja hallintoa. Kirkkoneuvosto toimii kirkkovaltuuston valmistelu- ja täytäntöönpanoelimenä.
Kirkkovaltuusto valitsee kirkkoneuvoston joka toinen vuosi.
Kirkkoneuvostoon voidaan valita vapaasti seurakuntavaaleissa vaalikelpoisia henkilöitä. Sama henkilö voidaan valita sekä kirkkovaltuustoon että kirkkoneuvostoon. Kirkkoneuvoston puheenjohtajana toimii virkansa puolesta kirkkoherra. Varapuheenjohtajan lisäksi kirkkoneuvostoon valitaan Pernajassa 10 luottamushenkilöä.
Kirkkovaltuusto valitsee viranhaltijat, ellei päätösvaltaa ole erikseen delegoitu kirkkoneuvostolle.
Valtuusto asettaa neuvoston avuksi johtokuntia. Ne johtavat seurakunnan eri työaloja ja toimintamuotoja. Kirkkoneuvosto edustaa seurakuntaa viranomaisasioissa sekä tekee sen puolesta sopimuksia ja muita oikeustoimia.
Pernajan seurakunnan kirkkoneuvoston jäsenet (varajäsenet) 2009
Kirkkoherra Robert Lemberg, puheenjohtaja
Nina Björkman-Nystén, varapuheenjohtaja
Henrik Blomqvist (Jan-Eric Björkell)
Maria Boberg (Anne Hovi)
Per-Olof Englund (Aino Mikkanen)
Satu Hämäläinen (Maria Drockila)
Leif Malmberg (Ralf Nordin)
Irja Murtoniemi (Marjo Vuokko
Christina Rantanen (Katarina Bäcklund)
Heli Rantanen (Päivi Tennberg)
Christoffer Sundberg (Lars Bäcklund)
Aki Virkki (Katja Korhonen)